Berdiri pada tahun 1983, Terletak di dusun Tegal Gentan Margoagung Seyegan Sleman. Berdiri diatas tanah seluas 2,05 hektar ditambah tanah lapang seluas kurang lebih 1 hektar. Sehingga tanah secara keseluruhan memiliki luas kurang lebih 3,05 hektar.
Pembangunan gedung Sekolah dimulai pada tahun 1983 dan selama gedung belum dapat ditempati untuk sementara rombongan belajar dititipkan, dan diampu oleh SMA N 4 Yogyakarta.
Kemudian mulai bulan April tahun 1984 seluruh siswa sudah menempati gedung baru di SMA N 1 Seyegan yang beralamat kan Tegal Gentan Margoagung Seyegan Sleman.
Dengan jumlah kelas pertama sebanyak 3 Robongan Belajar (Rombel) atau 3 kelas. Setiap Rombel terdiri dari 44 peserta/siswa dikalikan tiga menjadi 132 siswa.
Adapun Kepala Sekolah yang pertama adalah Bapak Drs. Marsono (SMA N 1 Wonosari), dari tahun 1984 s/d 1990. Bapak Drs. Marsono meninggal tahun 1990, sehingga terjadi kekosongan Kepala Sekolah, sementara terjadi kekosongan kepala sekolah maka Kanwil Dekdikbut Provinsi DIY mengangkat salah seorang Guru Senior SMA N 1 Seyegan yang pada waktu itu bernama Teguh Harnadi, B.A. sebagai Wakil Kepala Sekolah Sementara. Dilantik dan menjabat pada 19 Agustus 1991 dan berakhir pada tanggal 12 Desember 1991. Kemudian Kepala Sekolah berikutnya adalah Bapak Muji Harjono (SMA N 6 Yogyakarta) dari tanggal 12 Desember 1991 sampai pertengahan 1994. Kemudian kepala sekolah berikutnya Bapak Mardani, B.A. (SMA N 1 Sleman) mulai pertengahan 1994 s/d 30 juni 1999. Kepala Sekolah selanjutnya Bapak Paiman Darsih(SMA N 1 Kalibawang Kulon Progo), dilantik 30 Juni 1999 s/d 30 Juni 2011. pada 30 Desember 2011 bergatni Kepala Sekolah Drs. Samijo, M.M (SMAN 1 Minggir) kemudian menjabat sampai 2 periode dan berakhir 2018. periode berikutnya tahun 2018-2022 dijabat oleh Drs. Aris Sutardi, M.Sc (SMAN 1 Mlati). Kemudian Periode 2022 – Sekarang dijabat oleh Kristya Mintarja, S.Pd., M.Ed.st. (SMAN 1 Pakem).
Dari sisi perkembangan awal di dirikan SMA N 1 Seyegan bertipe C dengan jumlah Rombel 9 kelas, berturut – turut dari tahun ke tahun, sehingga sampai awal tahun pelajaran 1999 berubah setatus menjadi tipe B dengan jumlah rombel 18 kelas.
Dengan perincian kelas 1 jumlah 6 rombel, kelas 2 6 rombel dan kelas 3 ada 6 rombel dengan perincian : 1 rombel jurusan bahasa, 2 rombel jurusan IPA dan 3 rombel jurusan IPS. Dalam perkembangan berikutnya terjadi perubahan – perubahan khususnya dalam hal penjurusan, penjurusan dimulai kelas 2 yang sekarang disebut kelas 11 (XI) dengan komposisi jurusan IPA 3 kelas dan Jurusan IPS 3 Kelas. Dan sudah tidak membuka lagi jurusan Bahasa, karena kurangnya peminat.
Dari tingkat kepercayaan pemerintah/Akreditasi Sekolah, sejak tahun 2004 sampai sekarang berpredikat A. Bahkan dalam perkembangan berikutnya oleh lembaga penjaminan mutu / LPMP DIY pada awal tahun 2011 SMA N 1 Seyegan ditunjuk dan ditetapkan sebagai sekolah Model Penjaminan Mutu. untuk tingkat SLTA bersama dengan SMA N 1 Pleret.
Berkat prestasi olahraga yang sering diraih SMAN 1 Seyegan, maka pada tahun 2012 SMAN 1 Seyegan diberi kepercayaan oleh Dinas Pendidikan Kabupaten Sleman untuk membuka Kelas Khusus Olahraga dengan harapan mampu menampung siswa/i berbagat dalam bidang olahraga khusus wilayah sleman barat. dan ditahun 2015 dengan beralihnya pengelolaan jenjang SMA ke Propinsi maka KKO diterbitkan nya SK sebagai sekolah penyelenggara Kelas Khusus Olahraga Provinsi D.I.Yogyakarta.
pada tahun 2017 SMAN 1 Seyegan memperoleh tambahan satu kelas baru Program IPS sehingga secara pararel Rombel yang dimiliki sampai sekarang 4 kelas IPA dan 4 kelas IPS. dimana KKO masuk dalam Jurusan IPS 1 Rombel. dengan Total terdapat 24 Rombel ditahun 2019 dan pada tahun ajaran 2020/2021 menjadi 25 Rombel dengan total 12 Rombel IPA dan 13 Rombel IPS. Kemudian tahun 2021/2022 bertambah 1 rombel IPS sehingga menjadi 26 Rombel.
SMA N 1 Seyegan sebuah sekolah yang terletak di daerah pinggiran kota yogyakarta, tepatnya di Wilayah Sleman bagian barat, beralamat di Desa Tegal Gentan Margoagung Seyegan Sleman, yang menempati areal tanah seluas 3, 05 hektar. Tahun 2018 memperoleh Akreditasi Sekolah Predikat A (UNGGUL) dengan nilai 97.
SMA N 1 Seyegan didirikan sejak tahun 1983, tepatnya 1 Juli 1983, yang berarti usia saat ini ( 2022) telah 38 tahun, Usia sekolah yang sudah cukup matang.
:::: Beberapa Kepala yang pernah menjabat di SMA N 1 Seyegan ::::
- Tahun 1983 s.d 1984 : Drs. Edi Sugito , Mulai bertugas 1 Juli 1983.
- Tahun 1984 s.d 1990 : Drs. Marsono , Mulai bertugas 7 Maret 1984.
- Tahun 1990 s.d 1991 : Teguh Harnadi , B.A, Mulai bertugas 9 September 1990.
- Tahun 1991 s.d 1994 : Drs. Muji Hardjono , mulai bertugas : April 1991.
- Tahun 1994 s.d 1999 : Drs. Margani , Mulai bertugas 16 September 1994.
- Tahun 1999 s.d 2011 : Drs. Paiman Darsih, Mulai bertugas 30 Juni 1999.
- Tahun 2011 s.d 2018 : Drs. Samijo,M.M , Mulai bertugas 30 Desember 2011.
- Tahun 2018 s.d 2022 : Drs. Aris Surtardi, M.Sc. , Mulai bertugas 03 Juli 2018
- Tahun 2022 s.d 2024 : Kristya Mintarja, S.Pd., M.Ed.st. Mulai bertugas 1 April 2022
- Tahun 2024 s.d Sekarang : Fadmiyati, S.Pd. M.Pd. Mulai bertugas 1 Agustus 2024